Nelle foreste e nelle acque dell’Amazzonia c’é la più diversificata fauna già conosciuta.  Sono 324 tipi di mammiferi, 2500 specie di pesci ( ci sono meno di uno mila nel bacino del Congo, il rivale più vicino, e soltanto 250 in quello del Mississipi), 1800 specie di uccelli già identificati ( 1300 nella Foresta del Congo, ancora una volta al secondo posto).

L’Amazzonia possiede il più grande serpente velenoso delle Americhe, la surucucu “pico-de-jaca” com’é conosciuta, con più di tre metri.  Tuttavia, nella foresta ci sono meno serpenti pericolosi che in altre regioni.  Sono notevoli le non velenosi anaconda, boe e le loro parenti che possono arrivare fino a 13 metri e più di 200 chili.  I mammiferi sono, nella loro maggioranza de abitudini notturne e solitarie.  Un viaggiatore può camminare per la foresta lungo giorni, ascoltando dei rumori misteriosi, però senza trovare nessun gruppo di animali.  Gli uccelli acquatici, però, hanno nell’Amazzonia il loro paradiso.

La Regione dell’Amazonas ha 40 unità di conservazione federali (UCF) e 34 unità di conservazione regionali (UCR) ( nell’ottobre del 2008).  Sono, nel totale, 39,6 milioni di ettari di zone protette dalle unità di conservazione, oltre alle terre indigeni (TI), considerando le unità federali e regionali  insieme. Il Sistema Regionale di Unità di Conservazione, così come il Sistema Nazionale di Unità di Conservazione, stabiliscono che le unità di conservazione si dividano in due gruppi con caratteristiche specifiche: le Unità di Conservazione di Uso Sostenibile, che hanno per scopo far compatibili la conservazione della natura e l’uso sostenibile di una parte delle sue risorse naturali;e le Unità di Conservazione di Protezione Integrale, il cui obbiettivo é quello di preservare la natura, ammettendo soltanto l’uso indiretto delle sue risorse naturali.